Nächste Generation Sequenzierung

CD Genomics besteht darauf, Forschern auf der ganzen Welt hochwertige Next-Generation-Sequenzierungs (NGS) Dienstleistungen anzubieten.

Was ist NGS?

NGS, auch bekannt als Hochdurchsatz-Sequenzierung, ist eine DNA-Sequenzierungstechnologie, die die genomische und molekulare Forschung revolutioniert hat und alle Bereiche der biologischen Forschung beeinflusst hat. Sie ist in der modernen Gesellschaft zunehmend verbreitet geworden. NGS ermöglicht es uns, DNA und RNA viel genauer, schneller und kostengünstiger zu sequenzieren.

Bibliotheks-Sequenzierung ist eine Technik, die den ersten Schritt des Anbringens von Adaptern umfasst, zu denen Elemente wie Indexsequenzen, Barcodes und Bindungsregionen für Sequenzierungsprimer an beiden Enden der gewünschten Zielfragmente gehören. Anschließend werden diese vorbereiteten Fragmente mit einem speziellen Sequenzierer sequenziert. Im Gegensatz dazu, gezielte Sequenzierung zeichnet sich durch die selektive Erfassung bestimmter Gene oder Interessensregionen vor der Sequenzierungsphase aus. Bemerkenswerterweise bestehen die Hauptmethoden zur Durchführung von gezielter Sequenzierung aus Hybrid-Capture und Multiplex-PCR.

NGS-Dienste bei CD Genomics

Mit unserer langjährigen Erfahrung ist CD Genomics ein führender Anbieter von NGS-Dienstleistungen, um fortschrittliche Sequenzierung und Bioinformatiklösungen für seine globalen Kunden. Ausgestattet mit einer Vielzahl modernster Technologien und unterstützt von einem Team erfahrener Fachleute, verpflichtet sich CD Genomics, einen umfassenden Service anzubieten, der experimentelles Design, DNA-Isolierung, DNA-Fragmentierung, Bibliotheksvorbereitung, Sequenzierung und Bioinformatik umfasst. Dadurch liefern wir schnelle, kosteneffektive und qualitativ hochwertige Ergebnisse, die es Forschern ermöglichen, wissenschaftliche Durchbrüche zu erzielen.

Wir bieten beide Illumina-Sequenzierungsplattformen an, PacBio Einzelmolekül-Echtzeit (SMRT) und Nanopore-Technologien um eine Vielzahl von Forschungszielen und Ihrem Budget gerecht zu werden.

Unsere Technologien und Produkte wurden durch zahlreiche Partnerschaften mit akademischen Instituten, Diagnostikunternehmen und Testlaboren validiert.

Unsere NGS-Lösungen umfassen:

Genomsequenzierung

Die Genomsequenzierung ist die Methode, die hochdurchsatzfähige DNA-Sequenzierungstechniken zusammen mit fortschrittlichen bioinformatischen Werkzeugen nutzt, um die funktionalen und strukturellen Bestandteile eines gesamten Genoms zu erfassen und zu analysieren. Dieser umfassende Ansatz ermöglicht die Untersuchung individueller Unterschiede und Merkmale innerhalb von Populationen. Darüber hinaus ermöglicht die Durchführung de novo Sequenzierung und durch die Nutzung bioinformatischer Methoden wird es möglich, genetische Karten für verschiedene Arten abzuleiten.

Transkriptomik

Der Begriff "Transkriptom" umfasst die Gesamtheit der Transkripte, die von den Zellen oder Geweben einer bestimmten Art unter spezifischen Bedingungen erzeugt werden. Durch den Einsatz von Hochdurchsatz-Sequenzierung der zweiten Generation wird es möglich, effizient und umfassend Sequenzdaten zu nahezu allen Transkripten sowie Informationen über die differentielle Genexpression in den Geweben oder Organen einer bestimmten Art unter bestimmten Bedingungen zu erheben. Dieser Ansatz hat in verschiedenen Bereichen, einschließlich der Grundlagenforschung, klinischen Diagnostik und der pharmazeutischen Forschung und Entwicklung, umfangreiche Anwendung gefunden.

Epigenomik

Epigenetik, oft als Epigenomik, Epitranskriptomik oder Postgenetik bezeichnet, umfasst die Untersuchung dauerhafter Veränderungen in der Genexpression oder zellulären Eigenschaften, die durch spezifische Mechanismen auftreten, ohne die DNA-Sequenz zu verändern. Dieses Forschungsfeld findet Anwendung in den Bereichen Biologie und spezialisierten genetischen Disziplinen.

Mikrobielle Genomik

Die Mikrobiom-Sequenzierung umfasst den Prozess der Amplifikation der bemerkenswert variablen Segmente von Mikroben. 16S rDNA, 18S rDNA und ITS, gefolgt von Hochdurchsatz-Sequenzierung. Diese Methodik erleichtert die Untersuchung der Artenzusammensetzung und der Variationen der relativen Häufigkeit von Bakterien, Archaeen, Pilzen und anderen Mikroorganismen, die in einer bestimmten Umgebung vorhanden sind. Sie bietet wertvolle Einblicke in die strukturelle Zusammensetzung mikrobieller Gemeinschaften, evolutionäre Verbindungen sowie die Wechselwirkungen zwischen Mikroorganismen und ihrer Umgebung in Umweltproben.

Metagenomische SequenzierungIm Gegensatz dazu umfasst es die Untersuchung der genomischen Zusammensetzung mikrobieller Gemeinschaften in unterschiedlichen Umgebungen unter Verwendung von Hochdurchsatz-Sequenzierungstechniken. Dieser Ansatz ermöglicht die Erforschung der mikrobiellen Vielfalt, der Populationsdynamik, der Genfunktionalität, der Stoffwechselnetzwerke und der evolutionären Verbindungen. Darüber hinaus ermöglicht er die Untersuchung funktioneller Aktivitäten innerhalb mikrobieller Gemeinschaften, die Interaktionen zwischen verschiedenen Mikroorganismen und deren Wechselwirkungen mit der umgebenden Umwelt. Die Forschung in der Metagenomik-Sequenzierung überwindet die Herausforderungen, die mit der Kultivierung und Isolation von Mikroorganismen verbunden sind, erweitert den Anwendungsbereich mikrobieller Ressourcen und bietet ein wirksames Instrument zur Untersuchung von mikrobiellen Gemeinschaften in der Umwelt.

Darüber hinaus bieten wir auch an Long-Read-Sequenzierungsdienste

PacBio SMRT-Sequenzierung

Die PacBio Sequel-Sequenzierplattform ist die neueste Sequenzierungsplattform der dritten Generation von Pacific BioSciences und nutzt die Single-Molecule Real-Time (SMRT) Sequenzierungstechnologie. Sie bietet eine durchschnittliche Leseweite von bis zu 15 Kilobasen (Kb), wobei die längsten Reads 40-60 Kb erreichen. Das Sequenzierungssystem besteht aus 16 SMRT-Cell-Sequenziermodulen, von denen jedes in der Lage ist, 5-10 Gigabasen (Gb) an Daten zu erzeugen. Bemerkenswert ist, dass die SMRT-Technologie die Sequenzierung einzelner DNA-Moleküle ohne die Notwendigkeit einer Amplifikation ermöglicht, wodurch PCR-induzierte GC-Bias effektiv gemindert und eine umfassende und gleichmäßige Sequenzabdeckung sichergestellt wird. Derzeit findet die PacBio SMRT Sequenzierungstechnologie weitreichende Anwendungen in der komplexen Genomassemblierung und Vollständiges Transkriptom Sequenzierung von eukaryotischen Organismen.

Nanoporen-Sequenzierung

Nanopore-Sequenzierung basiert, wie der Name schon sagt, grundlegend auf der Nutzung eines Nanopores – einem winzigen Loch mit kovalent befestigten molekularen Adaptern. Das Nanopore-Protein ist sicher an einer Membran befestigt, während ein dynamisches Protein Nukleinsäuren durch das Nanopore hindurchführt. Wenn eine Nukleinsäure das Nanopore durchquert, verursacht sie Veränderungen in der Ladung, wodurch Schwankungen im Strom auf der Membran entstehen. Aufgrund des äußerst engen Durchmessers der Nanopores können nur einzelne Nukleinsäurepolymere hindurchtreten. Da die elektrischen Ladungseigenschaften der einzelnen Basen ATCG unterschiedlich sind, variiert die Störung, die sie im Strom erzeugen, wenn sie durch das Protein-Nanopore passieren. Durch kontinuierliches Überwachen und Dekodieren dieser Stromsignale kann die Bestimmung der Basensequenz erreicht werden, was die Sequenzierung ermöglicht.

CD Genomics nutzt die Nanopore-Plattform, um Tausende von Projekten zur Sequenzierung bakterieller Genome und Metagenome durchzuführen, einschließlich der Datenanalyse. Wir führen auch Tausende von vollständigen Transkriptom- und Direct RNA-Sequenzierungen durch, zusammen mit der anschließenden Datenanalyse.

Andere

Vorteile unserer NGS-Dienste:

Hochqualifiziertes und erfahrenes Personal
Modernste Instrumente und hochmoderne Technologien
Strenge Qualitätskontrolle
Personalisierte NGS- und maßgeschneiderte Bioinformatiklösungen, die auf Ihre Forschungsbedürfnisse zugeschnitten sind.
Professionelle Strategiedesign
Breites Anwendungsspektrum
Wettbewerbsfähiger Preis

Surfen Sie, um zu erfahren, wie wir Ihnen helfen können, Ihre Forschungsziele durch NGS-Technologien zu erreichen. Für weitere Informationen kontaktieren Sie uns bitte! Unsere branchenführenden Spezialisten auf Doktoratsniveau sind stets darauf bedacht, umfassende Unterstützung und technische Problemlösungen so schnell wie möglich bereitzustellen.

Nur für Forschungszwecke, nicht zur klinischen Diagnose, Behandlung oder individuellen Gesundheitsbewertung bestimmt.
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