Einführung
Die Ära der Genomik hat bemerkenswerte Fortschritte in der Sequenzierungstechnologie erlebt, die es Forschern ermöglichen, tiefer in die Komplexität des Genoms einzutauchen. Ein solcher Durchbruch ist das Aufkommen der Langzeit-Sequenzierung, die beispiellose Vorteile bei der Erfassung struktureller Variationen, alternativer Spleißung und der Expression von Gen-Isoformen bietet. CD Genomics, ein führendes Unternehmen im Bereich der Genomik, präsentiert stolz seinen hochmodernen Service zur Datenanalyse von Langzeit-Sequenzierungen (LRS).
Bioinformatische Analyse von Long-Read-Sequenzierungsdaten
Die Langlesesequenzierung (Nanopore-Sequenzierung und die Einzelmolekül-Echtzeitsequenzierung (SMRT)) erzeugt erweiterte Sequenzierungsreads und revolutioniert unsere Fähigkeit, die komplexe Landschaft des Genoms zu erkunden. Die Analyse dieser umfangreichen Datensätze stellt jedoch einzigartige Herausforderungen dar. CD Genomics nutzt mit seiner umfassenden Expertise in der bioinformatischen Analyse modernste Computerwerkzeuge und -pipelines, um diese Herausforderungen zu bewältigen und wertvolle Erkenntnisse aus den Daten der Langlesesequenzierung zu gewinnen.
Übersicht über Werkzeuge und Pipelines zur Analyse von Langsequenzen.
Qualitätskontrolle und Fehlerkorrektur
Hochwertige Daten sind entscheidend für eine genaue nachgelagerte Analyse. CD Genomics wendet strenge Qualitätskontrollmaßnahmen an, um die Integrität von Long-Read-Sequenzierungsdaten zu bewerten. Durch sorgfältiges Qualitäts-Trimming und Filtern stellen wir die Entfernung von Artefakten und niedrigqualitativen Reads sicher, um die Zuverlässigkeit nachfolgender Analysen zu erhöhen.
Gen/Gene-Isoform-Expression
Die Langzeit-Sequenzierung ermöglicht die umfassende Analyse der Genexpression und Isoformvielfalt. CD Genomics setzt ausgeklügelte Algorithmen und Werkzeuge ein, um die Gen- und Isoformexpressionsniveaus genau zu quantifizieren. Dies erleichtert die Identifizierung von unterschiedlich exprimierten Genen und Isoformen unter verschiedenen Bedingungen und wirft Licht auf entscheidende biologische Prozesse und regulatorische Mechanismen.
Neuartige Genentdeckung und Identifizierung von Voll-Längen-Isoformen
Die Entdeckung neuer Gene und vollständiger Isoformen ist entscheidend für das Verständnis des Genoms. CD Genomics nutzt fortschrittliche Methoden zur Transkriptomassemblierung, um vollständige Genstrukturen zu rekonstruieren und neue Gene sowie Isoformen mit hoher Präzision zu identifizieren. Durch die Nutzung der Möglichkeiten der Langsequenzierung erleichtert unser Service die Entdeckung zuvor nicht annotierter Gene und Transkriptvarianten.
De Novo Fusion-Gen-Detektion und Expressionsprofile von Fusionsisoformen
Fusionsgene, die durch genomische Umstellungen entstehen, spielen eine entscheidende Rolle bei Krebs und anderen Krankheiten. CD Genomics verwendet spezialisierte Algorithmen und Pipelines, um Fusionsgene zu erkennen und deren Expressionsprofile zu bestimmen. Durch eine eingehende Analyse von Fusionsisoformen hilft unser Service, die zugrunde liegenden Mechanismen der Krankheitsentwicklung und -progression zu entschlüsseln.
Allelspezifische Expression und Haplotypisierung
Das Verständnis von allelspezifischer Expression und Haplotypen ist entscheidend, um die Komplexität genetischer Variationen zu entschlüsseln. CD Genomics bietet präzise Analysen von Long-Read-Sequenzierungsdaten, um allelspezifische Expressionsmuster und Haplotypen zu entschlüsseln. Diese Informationen liefern Einblicke in die Regulation der Genexpression und die Auswirkungen genetischer Variationen auf phänotypische Merkmale.
De-novo-Genomassemblierung
Die De-novo-Genomassemblierung ist ein entscheidender Schritt zur Entschlüsselung komplexer Genome, insbesondere bei Nicht-Modellorganismen. CD Genomics nutzt modernste Assemblierungsalgorithmen, die für Long-Read-Sequenzierungsdaten optimiert sind, um hochwertige Genomassemblierungen zu rekonstruieren. Dies ermöglicht die Identifizierung von strukturellen Variationen, Genannotationen und genomweiten Analysen mit außergewöhnlicher Genauigkeit.
De-novo-Transkriptomassemblierung
CD Genomics bietet umfassende de novo Transkriptom-Assemblierungsdienste unter Verwendung von Langsequenzierungsdaten an. Durch den Einsatz fortschrittlicher Algorithmen rekonstruieren wir vollständige Transkript-Isoformen, decken alternative Spleißereignisse auf und liefern präzise Genannotationen. Dies ermöglicht Forschern, tiefere Einblicke in die transkriptomische Landschaft zu gewinnen und die Komplexität der Genregulation zu entschlüsseln.
Methylierung, Nucleosomenpositionierung und Chromatinzugänglichkeit
Epigenetische Modifikationen spielen eine entscheidende Rolle bei der Genregulation und der Krankheitsentwicklung. CD Genomics bietet eine umfassende Analyse von Langsequenzierungsdaten, um DNA-Methylierungsmuster zu identifizieren, die Positionierung von Nukleosomen zu bestimmen und die Chromatinzugänglichkeit zu bewerten. Durch die Analyse von Langsequenzierungsdaten kann CD Genomics die Positionen von Nukleosomen genau kartieren und die Chromatinzugänglichkeit im gesamten Genom beurteilen. Diese Informationen liefern wertvolle Einblicke in die Genregulation, die Chromatinstruktur und die Auswirkungen epigenetischer Modifikationen auf zelluläre Prozesse.
Vorteile des Long-Read-Sequenzierungsdatenanalyse-Service von CD Genomics
Unvergleichliche Genauigkeit und Präzision: Unser erfahrenes Team gewährleistet die höchsten Standards der Datenanalyse und liefert genaue und präzise Ergebnisse.
Maßgeschneiderte Datenanalyse-Lösungen: Wir passen unsere Analyse-Pipelines an Ihre spezifischen Forschungsziele an und bieten maßgeschneiderte Lösungen für Ihre einzigartigen Projektanforderungen.
Modernste Bioinformatik-Pipelines: Wir nutzen hochmoderne Bioinformatik-Pipelines, die für die Analyse von Langsequenzierungsdaten optimiert sind und die neuesten Algorithmen und Werkzeuge integrieren.
Umfassende Berichterstattung und Interpretation: Unser Service umfasst detaillierte Analyseberichte und klare Interpretationen der Ergebnisse, die es Ihnen ermöglichen, aussagekräftige Erkenntnisse aus den Daten zu gewinnen.
Effiziente Bearbeitungszeit: Wir legen Wert auf zeitnahe Ergebnisse, ohne dabei die Qualität zu beeinträchtigen, und stellen sicher, dass Sie Ihre Analyseergebnisse innerhalb der vereinbarten Fristen erhalten.
Vertraulichkeit und Datensicherheit: Wir halten strenge Datenmanagementprotokolle ein und setzen robuste Sicherheitsmaßnahmen ein, um die Vertraulichkeit und Integrität Ihrer Sequenzierungsdaten zu gewährleisten.
Durch die Wahl des Long-Read-Sequenzierungsdatenanalyse-Service von CD Genomics erhalten Sie Zugang zu präzisen und maßgeschneiderten Analysen, modernsten bioinformatischen Pipelines, umfassenden Berichten, effizienten Bearbeitungszeiten und Datensicherheit, die es Ihnen ermöglichen, Ihre genomische Forschung mit Vertrauen voranzutreiben.
Nur für Forschungszwecke, nicht zur klinischen Diagnose, Behandlung oder individuellen Gesundheitsbewertung bestimmt.
Richtlinien zur Einreichung von Proben
