Richtlinien zur Einreichung von Proben
Warum die Forschung zur genetischen Vielfalt fortschrittliche SNP-Genotypisierung benötigt
Das Verständnis der menschlichen genetischen Vielfalt ist entscheidend für die Populationsgenomik, die Arzneimittelentdeckung und großangelegte Assoziationsstudien. Dennoch stehen Forscher oft vor einer kritischen Herausforderung: Viele Genotypisierungsplattformen wurden unter Verwendung von Referenzdaten entwickelt, die globale Populationen unzureichend repräsentieren. Diese Einschränkung verringert die Genauigkeit von genomweiten Assoziationsstudien (GWAS) und schränkt die Erkenntnisse über genetische Varianten mit klinischer oder landwirtschaftlicher Relevanz ein.
Der Infinium Global Diversity Array (GDA) wurde entwickelt, um diese Lücke zu schließen. Mit mehr als 1,8 Millionen sorgfältig ausgewählten Markern erfasst das Array genetische Variation über verschiedene Abstammungen hinweg und verbessert sowohl die Abdeckung als auch die Auflösung. Für Forschungsinstitute, CROs und pharmazeutische F&E-Gruppen bedeutet dies zuverlässigere Genotypisierungsergebnisse, stärkere statistische Power und global relevante Datensätze.
Durch die Kombination von hochauflösender SNP-Abdeckung mit der robusten Infinium-Technologie von Illumina bietet das Global Diversity Array eine effiziente, skalierbare Lösung für Projekte, die Genauigkeit in unterschiedlichen Populationen erfordern. Es ermöglicht Forschern, über Studien zu einzelnen Populationen hinauszugehen und eine Grundlage für inklusive, vergleichende Genomforschung zu schaffen.
Was ist das Infinium Global Diversity Array?
Der Infinium Global Diversity Array (GDA) ist eine Hochdurchsatz-Genotypisierungsplattform, die von Illumina entwickelt wurde, um genetische Studien im Bevölkerungsausmaß zu unterstützen. Sie basiert auf der bewährten Infinium-Chemie und liefert robuste, reproduzierbare SNP-Genotypisierungsergebnisse.
In der Forschung werden häufig zwei Versionen des Arrays verwendet:
Infinium Global Diversity Array-8 (GDA-8) – ein Format mit mittlerem Durchsatz, das für akademische Projekte und gezielte Kohortenstudien entwickelt wurde.
Infinium Global Diversity Array-24 (GDA-24) – eine Hochdurchsatzoption, die großangelegte Studien ermöglicht und sich ideal für Auftragsforschungsinstitute (CROs) und pharmazeutische Forschungsteams eignet.
Beide Arrays enthalten mehr als 1,8 Millionen sorgfältig ausgewählte Einzel-Nukleotid-Polymorphismen (SNPs), mit einem Schwerpunkt auf der Repräsentation über mehrere globale Populationen hinweg. Dies macht sie zu leistungsstarken Werkzeugen für genomweite Assoziationsstudien, Ahnenforschung und Pharmakogenomik.
Durch die Kombination umfassender Markerabdeckung mit flexiblen Durchsatzoptionen ermöglicht das Infinium Global Diversity Array Forschern, die Plattform auszuwählen, die am besten zu ihrem Projektumfang und Budget passt, während eine hohe Konsistenz über die Datensätze hinweg gewährleistet bleibt.
Wahl zwischen Infinium GDA-8 und GDA-24
Der Infinium Global Diversity Array bietet zwei Durchsatzformate an, um unterschiedlichen Projektbedürfnissen gerecht zu werden. Beide Plattformen liefern identische SNP-Markerinhalte und -qualität, unterscheiden sich jedoch in Maßstab und Effizienz.
| Merkmal | Infinium GDA-8 | Infinium GDA-24 |
|---|---|---|
| Durchsatz | Mittel-Durchsatz | Hochdurchsatz |
| Proben pro Array | 8 | 24 |
| Am besten geeignet für | Akademische Projekte, gezielte Kohorten, Pilotstudien | Großangelegte Bevölkerungsstudien, CRO, pharmazeutische F&E |
| Vorteile | Kostenwirksam für kleinere Stichproben; derselbe SNP-Inhalt wie GDA-24 | Geringere Kosten pro Probe; skalierbar für Tausende von Proben |
| Datenvergleichbarkeit | Vollständig vergleichbar mit GDA-24 | Vollständig vergleichbar mit GDA-8 |
| Typische Benutzer | Universitäten, Forschungsinstitute | CROs, Pharmaunternehmen, große Konsortien |
Hauptvorteile des Infinium Global Diversity Array Service
Der Infinium Global Diversity Array-Dienst bietet mehrere Vorteile, die es zur bevorzugten Wahl für Forscher machen, die großangelegte SNP-Genotypisierungsstudien durchführen.
- Umfassende Genomabdeckung
Mit mehr als 1,8 Millionen Markern, die aus globalen Referenzpanels ausgewählt wurden, bietet das Array eine ausgewogene Repräsentation über verschiedene Populationen. Dies gewährleistet eine verbesserte Variantenentdeckung und unterstützt inklusive Forschung.
- Flexible Durchsatzoptionen
Forscher können zwischen dem wählen Infinium GDA-8 für moderate Stichprobengrößen oder die Infinium GDA-24 für Hochdurchsatzprojekte. Beide Formate bieten konsistente Leistung und Kosteneffizienz.
- Hohe Genauigkeit und Reproduzierbarkeit
Basierend auf der Infinium-Technologie von Illumina ist die Plattform bekannt für ihre robuste Chemie und standardisierte Arbeitsabläufe. Diese Konsistenz ist entscheidend für die Zusammenarbeit über Kohorten und Standorte hinweg.
- Projektübergreifende Vergleichbarkeit
Die Anordnung ist in der akademischen Forschung, der Auftragsforschung (CRO) und der pharmazeutischen Forschung weit verbreitet. Die Verwendung einer gemeinsamen Plattform gewährleistet die Datenvergleichbarkeit über Studien hinweg und erleichtert Meta-Analysen sowie globale Forschungszusammenschlüsse.
Durch die Kombination von Abdeckung, Durchsatzflexibilität und Reproduzierbarkeit ermöglicht der Infinium Global Diversity Array-Service Forschern, die Einschränkungen kleinerer oder bevölkerungsbeschränkter Genotypisierungs-Panels zu überwinden. Er bietet die Datenqualität, die für fundierte Schlussfolgerungen in der Populationsgenomik und darüber hinaus erforderlich ist.
Arbeitsablauf
Anwendungen in Forschung und Industrie
Der Infinium Global Diversity Array-Dienst unterstützt eine Vielzahl von Forschungsbereichen, indem es zuverlässige SNP-Genotypisierung über verschiedene Populationen hinweg bereitstellt. Seine breite Abdeckung und Skalierbarkeit machen es in mehreren Bereichen wertvoll:
Humangenetik und Populationsgenomik
Das Array wird häufig verwendet in genomweite Assoziationsstudien (GWAS)Ahnenforschung und Analyse der Populationsstruktur. Durch die Einbeziehung von Markern, die verschiedene Abstammungen repräsentieren, ermöglicht die Plattform umfassendere und genauere genetische Studien.
Pharmazeutische F&E und CRO-Projekte
CROs und Pharma-Teams wenden das Array in Pharmakogenomik und Biomarker-Entdeckung. Konsistente, hochdichte SNP-Genotypisierung hilft Forschern, genetische Variabilität in Studien zur Arzneimittelreaktion und in translationalen Biologieprojekten zu bewerten.
Agrarische Genomik
Über menschliche Studien hinaus unterstützt das Array Tier- und Pflanzenzuchtgenetik Forschung. Die hochauflösende SNP-Abdeckung kann Zuchtprogramme beschleunigen und das Verständnis genetischer Variation bei landwirtschaftlichen Arten verbessern.
Großangelegte Kohortenstudien
Der Infinium GDA-24 Das Format eignet sich besonders für nationale oder internationale Konsortien, in denen Tausende von Proben mit Genauigkeit und Konsistenz genotypisiert werden müssen.
Durch die Aktivierung von Anwendungen in der humanen, pharmazeutischen und landwirtschaftlichen Forschung bietet das Infinium Global Diversity Array ein vielseitiges Werkzeug für Organisationen, die robuste Genotypisierungsdaten in großem Maßstab suchen.
Datenqualität und Zuverlässigkeit, unterstützt durch Branchenstandards
Hochwertige und reproduzierbare Daten sind entscheidend für die SNP-Genotypisierung im Bevölkerungsmaßstab. Die Infinium Global Diversity Array-Dienst basiert auf der Infinium-Technologie von Illumina, die in akademischen und industriellen Forschungsprojekten umfassend validiert wurde.
Mehrere Merkmale tragen zur Datenzuverlässigkeit bei:
Validierte Chemie und Arbeitsabläufe
Die Infinium-Technologie ist eine etablierte Plattform mit robuster Hybridisierung und Erweiterungschemie, die konsistente Ergebnisse über Chargen und Standorte hinweg gewährleistet.
Adoption in globalen Forschungsverbünden
Die Global Diversity Array wurde in großen internationalen Studien eingesetzt, einschließlich multi-ethnischer GWAS-Projekte und Pharmakogenomik-Initiativen. Ihre Verwendung in Konsortien zeigt Vertrauen in ihre Genauigkeit und Vergleichbarkeit.
Strenge Qualitätskontrolle (QC)
Bei CD Genomics durchläuft jedes Projekt strenge QC-Schritte, von der Bewertung des DNA-Eingangs bis zur Filterung der Genotyp-Daten. Dies garantiert zuverlässige Ergebnisse für nachfolgende statistische Analysen.
Reproduzierbarkeit über Kohorten hinweg
Standardisierte Arbeitsabläufe stellen sicher, dass Daten, die an verschiedenen Standorten oder zu unterschiedlichen Zeitpunkten generiert werden, direkt vergleichbar bleiben. Dies ist entscheidend für longitudinale Studien und kollaborative Forschung.
Durch die Kombination von Illuminas bewährter Plattform mit der Expertise von CD Genomics in Projektmanagement und Bioinformatik können Forscher sowohl auf die Genauigkeit als auch auf die Reproduzierbarkeit ihrer Genotypisierungsergebnisse vertrauen.
Warum mit CD Genomics für Infinium GDA-Dienste zusammenarbeiten?
Die Auswahl des richtigen Dienstleisters ist entscheidend, um den Wert des Infinium Global Diversity Array (GDA)Bei CD Genomics kombinieren wir fortschrittliche Technologie mit tiefgreifendem Fachwissen in der Populationsgenomik und SNP-Array-Analyse, um zuverlässige und umsetzbare Ergebnisse zu liefern.
Unsere Stärken umfassen:
End-to-End-Projektunterstützung
Von der Proben-QC, DNA-Extraktion und Array-Verarbeitung bis hin zur bioinformatischen Analyse verwalten wir jeden Schritt des Workflows, um die Variabilität zu minimieren und die Projektzeitpläne zu beschleunigen.
Erfahrenes technisches Team
Unsere Spezialisten verfügen über umfangreiche Erfahrung mit der Illumina Infinium-Technologie, die eine genaue Genotypisierung und nahtlose Datenverarbeitung gewährleistet.
Angepasste bioinformatische Lösungen
Wir bieten umfassende Analyse-Pipelines an, einschließlich SNP-Call, Qualitätsbewertung, Analyse der Populationsstruktur und GWAS-bereitgestellten Datensätzen.
Skalierbare Kooperationen
Ob wir ein Pilotprojekt im akademischen Bereich unterstützen oder ein großes CRO- oder pharmazeutisches F&E-Programm leiten, wir bieten flexible Kapazitäten, um der Größe und Komplexität des Projekts gerecht zu werden.
Durch die Partnerschaft mit CD Genomics erhalten Forscher Zugang zu bewährten Arbeitsabläufen, fortschrittlicher Bioinformatik und einem Servicemodell, das darauf ausgelegt ist, hochwertige SNP-Genotypisierung in jedem Maßstab zu unterstützen.
Häufig gestellte Fragen (FAQ)
Q1: Wofür wird das Infinium Global Diversity Array verwendet?
Der Infinium Global Diversity Array (GDA) wird für großangelegte verwendet SNP-Genotypisierung, die Bevölkerungsgenomik, GWAS, Ahnenforschung, Pharmakogenomik und Forschung zur Agrargenetik ermöglichen.
Q2: Was ist der Unterschied zwischen Infinium GDA-8 und GDA-24?
Beide Arrays enthalten identischen SNP-Inhalt (>1,8 Millionen Marker). Der Unterschied liegt im Durchsatz: GDA-8 unterstützt kleinere Projekte oder Pilotstudien, während GDA-24 ist für die Hochdurchsatz-Genotypisierung großer Kohorten bei niedrigeren Kosten pro Probe ausgelegt.
Q3: Wie zuverlässig sind die Ergebnisse des Infinium Global Diversity Array?
Die Plattform basiert auf Illumina Infinium-Technologie, global validiert und in großen Forschungskonsortien weit verbreitet. CD Genomics wendet strenge Qualitätskontrollmaßnahmen während der Probenvorbereitung und Datenanalyse an, um Genauigkeit und Reproduzierbarkeit sicherzustellen.
Q4: Welche Art von Datenlieferungen kann ich erwarten?
Die Liefergegenstände umfassen typischerweise rohe Genotypdaten, Qualitätskontrollberichte und verarbeitete SNP-Datensätze, die für nachgelagerte Analysen, wie z. B. Studien zur Populationsstruktur oder GWAS, bereit sind.
Q5: Warum sollte ich mich für CD Genomics für diesen Service entscheiden?
CD Genomics bietet End-to-End Infinium Global Diversity Array-Dienste, kombiniert Probenvorbereitung, Genotypisierung und Bioinformatik-Expertise. Unsere flexible Kapazität unterstützt sowohl kleine akademische Projekte als auch großangelegte CRO- oder pharmazeutische F&E-Kooperationen.
Demo
GWAS Manhattan-Diagramm aus der Infinium Global Diversity Array-8 Kohorte.
CNV- und LOH-Tracks von der Infinium Global Diversity Array mit Zytogenetik 8.
Repräsentativer SNP-Cluster-Plot von der Illumina Infinium Global Diversity Array.
Zusammenfassung des polygenen Risikoscores aus der Infinium Global Diversity Array-8 Kohorte.
