Richtlinien zur Einreichung von Proben
Was ist Multi-Omics-Analyse?
Multi-Omics-Analyse ist ein systembiologischer Ansatz, der mehrere molekulare Ebenen integriert—Genomik, Transkriptomik, Epigenomik, Proteomikund Metabolomik—um eine umfassende Sicht auf biologische Mechanismen zu erzeugen. Im Gegensatz zu Single-Omics-Studien, die sich auf einen molekularen Bereich konzentrieren, Multi-Omikationen erfasst den Austausch zwischen Genen, Transkripten, Proteinen und Metaboliten und ermöglicht eine genauere Modellierung biologischer Funktionen, Krankheitsverläufe und therapeutischer Reaktionen.
Egal, ob Sie regulatorische Schaltkreise im Krebs aufdecken, Pflanzeneigenschaften optimieren oder Wirts-Mikrobe-Interaktionen profilieren, die Analyse von Multi-Omics-Daten liefert ein tieferes, reproduzierbareres Verständnis des Systems.
Wesentliche Vorteile von Multi-Omics-Ansätzen:
- Entschlüsselt komplexe Interaktionen über die Grenzen der Einzel-Omik hinaus.
- Kreuzvalidiert Ergebnisse über biologische Schichten hinweg für verbesserte Genauigkeit.
- Ermöglicht die Entdeckung von multimodalen Biomarkern und Wegsignaturen.
- Bietet hohe Empfindlichkeit, um niedrig-abundante, aber kritische Ziele zu erkennen.
- Unterstützt sowohl hypothesengetriebenes als auch entdeckungsbasiertes Forschen.
Warum Multi-Omics die moderne Biowissenschaft transformiert
Die Integration vielfältiger Omics-Daten ist sowohl in akademischen als auch in industriellen Bereichen unerlässlich geworden. Von biomedizinische Entdeckung zu Agrar-Genomik und Umweltwissenschaften, Multi-Omics-Integration ermöglicht präzisere Forschungsergebnisse, beschleunigt Innovationen und reduziert das Entwicklungsrisiko.
Biomedizinische Forschung & Arzneimittelentwicklung
- Identifizieren Sie krankheitsspezifische Treiber über genomische, transkriptomische und epigenomische Ebenen hinweg.
- Vorhersage von therapeutischen Zielen und Resistenzmechanismen
- Verfolgen Sie die Behandlungsergebnisse und die Immunmodulation mithilfe longitudinaler Omik-Daten.
Pflanzen-, Mikrobiom- und Umweltstudien
- Stressresistenz und Ertragseigenschaften durch omikagestützte Züchtung verbessern
- Entdecken Sie die Wechselwirkungen zwischen Boden, Pflanzen und Mikrobiom durch die Integration von Amplicon- und Metabolomik.
Überwachung von Umweltverschmutzern durch mehrstufige biomolekulare Profilierung
Multi-Omik-Integrationsstrategien
Transkriptomik + Metabolomik
Diese Dual-Layer-Strategie verknüpft die Genexpression mit nachgelagerten metabolischen Veränderungen und bietet sowohl kausale als auch phänotypische Perspektiven. Ideal für:
- Wachstums- und Entwicklungsstudien
- Immunantwort-Profilierung
- Stressresistenzforschung
- Entdeckung von Biomarkern bei chronischen Krankheiten
Transkriptomik + Proteomik
Untersuchen Sie den vollständigen Kaskadenprozess der Genregulation, indem Sie die mRNA- und Proteinexpression gemeinsam analysieren. Dieser Ansatz erfasst sowohl die transkriptionale Aktivität als auch die posttranskriptionale Modulation und deckt verborgene regulatorische Ereignisse auf.
- Offenlegung von Übersetzungsengpässen und kompensatorischen Wegen
- Vergleichen Sie die Gene-zu-Protein-Korrelationen unter Stress oder Krankheit.
- Verbessern Sie die Validierung von Biomarkern mit Nachweisen auf Proteinebene.
Epigenomik + Transkriptomik + Genomik
Dieser Tri-Omics-Ansatz bietet einen umfassenden Überblick über die Genregulation – er verbindet Sequenzvarianten, epigenetische Modifikationen (wie DNA-Methylierung und Histonmarkierungen) und die nachgelagerte Genexpression.
- Kartierung der regulatorischen Regionen, die die Genaktivierung steuern.
- Charakterisierung von Krebsuntertypen und Entwicklungsstadien
- Identifizieren Sie krankheitsassoziierte Varianten in nicht-kodierenden Regionen.
Beliebte Werkzeuge:
WGBS, RRBS, ChIP-seq, RNA-Seqund Whole-Genome-Sequenzierung (WGS)
Amplicon-Sequenzierung + Metabolomik
Speziell für Mikrobiomstudien entwickelt, deckt diese Kombination auf, wie mikrobielle Populationen den Stoffwechsel von Wirten oder der Umwelt beeinflussen.
- Studie zur Modulation der Wirtsimmunsystemwege durch das Mikrobiom des Darms
- Verfolgen von Bodenmikroben-Gemeinschaften, die den Stickstoffkreislauf steuern
- Identifizieren Sie mikrobielle Metaboliten, die mit Krankheitszuständen korreliert sind.
Beispielanwendungsfall:
Verknüpfung 16S rRNA-Sequenzierung von der Darmflora mit metabolomischen Veränderungen in der Produktion von kurzkettigen Fettsäuren.
Jedes Projekt wird von einem engagierten Bioinformatikteam unterstützt, das Ihnen hilft:
- Wählen Sie optimale Omics-Kombinationen aus.
- Entwerfen Sie eine Studie, die sowohl Entdeckung als auch Validierung unterstützt.
- Integrieren Sie öffentliche Daten (z. B. TCGA, GEO), um die Interpretierbarkeit zu verbessern.
Angepasste Bioinformatik & Datenanalyse
Von Rohdaten der Multi-Omik zu biologischen Erkenntnissen
Bei CD Genomics erkennen wir, dass die Sequenzierung nur der erste Schritt ist. Der wahre Wert von Multi-Omics-Analyse liegt im Dateninterpretation—Terabytes roher Informationen in umsetzbare biologische Bedeutung übersetzen. Das ist der Bereich, in dem unser maßgeschneiderte bioinformatische Lösungen Komm rein.
Unser Expertenteam – bestehend aus Molekularbiologen, Statistikern und Datenwissenschaftlern – arbeitet eng mit Ihnen zusammen, um jeden analytischen Schritt anzupassen und sicherzustellen, dass Ihr Multi-Omics-Datenanalyse stimmt mit Ihrer biologischen Hypothese, dem Studiendesign und den Publikationszielen überein.
Warum personalisierte Bioinformatik wichtig ist
Standardisierte Arbeitsabläufe können subtile regulatorische Ereignisse oder systemweite Interaktionen übersehen. CD Genomics bietet vollständig angepasste Pipelines an, um:
- Integrieren Sie heterogene Datensätze (z. B. RNA-seq + ChIP-seq + LC-MS)
- Ordnen Sie Omics-Daten mit öffentlichen Datenbanken (TCGA, GEO, ENCODE) zu.
- Konstruiere regulatorische und metabolische Netzwerke.
- Entdecken Sie Treiber-Gene, epigenetische Schalter und therapeutische Ziele.
- Korreliere molekulare Signaturen mit klinischen Phänotypen oder Therapieansprechen.
Unser Ansatz vereint biologische Relevanz und statistische Strenge – und liefert Ergebnisse, die reproduzierbar, aufschlussreich und bereit für die Begutachtung durch Fachkollegen sind.
Kernanalytische Fähigkeiten
| Analyse-Typ | Wesentliche Ergebnisse |
|---|---|
| Differenzielle Expression / Häufigkeit | Vulkanplots, Heatmaps, Fold-Change-Tabellen |
| Multi-Omik-Integration | MOFA, Korrelationsmatrizen, Clusteranalyse |
| Weg und GO-Anreicherung | KEGG, Reactome, STRING, GSEA |
| Netzwerkaufbau | TF-Gen-Netzwerke, Protein-Interaktionskarten |
| Methylierung und epigenetische Profilierung | DMRs, Chromatin-Zugänglichkeit-Karten (ATAC-seq) |
| Biomarker-Entdeckung | Prädiktive Marker, die mit Krankheiten, Eigenschaften oder Reaktionen verbunden sind |
| Öffentliche Datenbankanalyse | GEO/TCGA-Daten-Neuannotation und Co-Analyse |
| Klinische Assoziationskartierung | Überlebensanalyse, Immuninfiltration, Risikobewertung |
Arbeitsablauf
Warum CD Genomics wählen?
Ein vertrauenswürdiger Partner für Multi-Omics-Entdeckungen
Fortgeschrittene Technologische Infrastruktur
- Sequenzierungsplattformen: Illumina NovaSeq, PacBio Sequel II, MGI DNBSEQ und Oxford Nanopore
- Multi-Omics bereit: Von WGS und RNA-seq zu ChIP-seq, ATAC-seq, LC-MS/MS und RRBS
- Automatisierung & Durchsatz: Hohe Kapazität für großangelegte Omikastudien
Experten für Bioinformatik und Systembiologie Team
- Interdisziplinäre Spezialisten in Onkologie, Mikrobiologie, Pflanzenwissenschaften und Datenwissenschaft.
- Angepasste Pipelines für die Integration von Multi-Omics-Daten, das Mining öffentlicher Datenbanken (TCGA, GEO) und die Interpretation von Signalwegen.
- Veröffentlichungsreife Berichterstattung mit Visualisierungen und regulatorischen Einblicken
Flexibles, End-to-End-Service-Ökosystem
- Unterstützung für Single-Omics- und Multi-Omics-Projekte in allen Phasen
- Einstufiger Workflow: Proben-QC → Bibliotheksvorbereitung → Sequenzierung → Daten-QC → Integration → Bericht
- Co-Entwicklung von Datenstrategien für neuartige Ziele, translationale Forschung und Veröffentlichungsplanung
Hochwirksame Dateninterpretation
- Integrieren Sie klinische Metadaten, experimentelle Kontrollen und Phänotypkorrelationen.
- Verwendung fortschrittlicher Werkzeuge: MOFA, DESeq2, STRING, KEGG, Cytoscape und Algorithmen des maschinellen Lernens
- Standardisierte QC-Metriken und Reproduzierbarkeitsrahmen, die in jedes Projekt integriert sind.
Forscherorientierte Unterstützung
- Zweisprachige Projektmanager und Doktorandenberater während des gesamten Projekts verfügbar.
- Unterstützung bei der Vorbereitung von SCI-Manuskripten, der Einreichung bei Zeitschriften und den Antworten auf Peer-Reviews.
- Langfristige Partnerschaften mit CROs, akademischen Laboren und pharmazeutischen Innovatoren
Herunterladbare Poster-Ausstellung
RNA-Seq, ATAC-Seq und CRISPR-Screening
Antrieb der CAR-T-Zellforschung durch Multi-Omik
Entdecken Sie, wie integrierte transkriptomische, epigenomische und funktionelle Screening-Daten die Mechanismen der T-Zell-Erschöpfung aufdecken.
ChIP-seq und RNA-seq Integration
Dekodierungsmechanismen in Stammzellen des Pankreaskrebses
Untersuchen Sie, wie die Dual-Omics-Profilierung epigenetische Regulatoren und transkriptionale Veränderungen in CSC-Populationen identifiziert.
Beispielanforderungen
Optimierter Prozess. Hochwertige Ergebnisse.
Wir akzeptieren die folgenden Probenarten für Multi-Omics-Projekte:
- Genomik: Genomisches DNA (≥1 μg, OD260/280 = 1,8–2,0)
- Transkriptomik: Gesamt-RNA (≥2 μg, RIN ≥7)
- Epigenomik: Hochwertige DNA- oder Chromatinextrakte
- Proteomik: Zell-/Gewebe-Lysate oder gereinigte Proteine (≥100 μg)
- Metabolomik: Bioflüssigkeiten, Gewebe, mikrobielle Pellets (schnell eingefroren, ≥100 mg oder 200 μL)
Bitte konsultieren Sie unser technisches Team bezüglich artspezifischer Anforderungen oder individueller Formate.
Häufig gestellte Fragen: Multi-Omics-Service
Q1: Welche Omics-Typen können in einem Projekt integriert werden?
Wir unterstützen flexible Kombinationen von Genomik, Transkriptomik, Epigenomik, Proteomik und Metabolomik. Sie können 2–5 Schichten basierend auf Ihrer biologischen Fragestellung und Ihren Projektzielen auswählen.
Q2: Kann ich meine eigenen Sequenzierungsdaten zur Integration bereitstellen?
Ja. Wir akzeptieren externe Datensätze in Standardformaten und können diese mit neu generierten Omics-Daten oder öffentlichen Datenbanken (z. B. TCGA, GEO) im Rahmen eines maßgeschneiderten Analyseplans integrieren.
Q3: Welche Arten von Forschungsfragen kann Multi-Omik beantworten?
Multi-Omics-Analysen sind ideal, um regulatorische Mechanismen aufzudecken, Biomarker zu identifizieren, Krankheitsuntertypen zu profilieren, Stress- oder Immunantworten zu verstehen und die Interaktionen zwischen Wirt und Mikrobiom zu kartieren.
Q4: Welche Liefergegenstände werde ich erhalten?
Sie erhalten einen vollständigen Bericht mit annotierten Datentabellen, interaktiven Diagrammen, Wegdiagrammen, Netzwerkplänen und publikationsfertigen visuellen Abbildungen. Sowohl Roh- als auch verarbeitete Datendateien sind enthalten.
Q5: Wie stellen Sie die Datenqualität und Reproduzierbarkeit sicher?
Wir wenden strenge Qualitätskontrollen in jeder Phase an – von der Probenbewertung über die Sequenzierung, Datenvorverarbeitung bis hin zur statistischen Modellierung. Die Kreuzvalidierung über verschiedene Omics-Ebenen verbessert die Zuverlässigkeit und reduziert das Rauschen.
Q6: Können Sie bei der Manuskriptvorbereitung oder der nachgelagerten Analyse helfen?
Ja. Wir bieten optionale Unterstützung beim Schreiben von Manuskripten, der Formatierung von Abbildungen und bei Antworten auf Peer-Reviews an. Auf Anfrage stellen wir auch erweiterte Datenanalyse- und Interpretationsdienste zur Verfügung.
Q7: Wie sollte ich mit einem Multi-Omics-Projekt beginnen?
Kontaktieren Sie uns einfach mit Ihren Projektzielen und den verfügbaren Probenarten. Unser wissenschaftliches Team wird Ihnen helfen, die optimale Omics-Strategie zu entwerfen und Sie durch die Probenübermittlung und die Planung des Workflows zu führen.
Hier sind einige Publikationen, die erfolgreich mit unseren Dienstleistungen oder anderen verwandten Dienstleistungen veröffentlicht wurden:
Die HLA-Klasse-I-Immunopeptidome der AAV-Kapsidproteine
Zeitschrift: Frontiers in Immunologie
Jahr: 2023
Vollständige Genomsequenz des Bifidobacterium adolescentis Stammes SD-VA1
Journal: Mikrobiologie Ressourcenankündigungen
Jahr: 2020
Charakterisierung von Salmonella aus Einzelhandels-Schweinefleisch mittels Ganzgenomsequenzierung
Zeitschrift: Frontiers in Microbiology
Jahr: 2022
DNA-Methylierung sagt Rekombination in Reis unter Verwendung von Whole-Genome-Bisulfid-Sequenzierung voraus.
Zeitschrift: Zeitschrift für Integrative Pflanzenbiologie
Jahr: 2023
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