Fallstudie

Plasmid-vermittelter Gentransfer spielt eine wichtige Rolle nicht nur bei der Mobilisierung und Verbreitung von Antibiotikaresistenz- und Virulenzgenen, sondern auch bei der Evolution mikrobieller Populationen. CD Genomics bietet einen vollständigen Plasmid-DNA-Sequenzierungsdienst und verbesserte bioinformatische Pipelines, die zuverlässige und genaue Daten liefern.

Bipolare Störung (BD) ist eine chronische Gehirnerkrankung, die durch wiederkehrende Episoden von Manie und Depression gekennzeichnet ist, und SYNES1 wird als Locus loci für BD betrachtet. CD Genomics bietet ein effektives und kostengünstiges gezieltes Regionssequenzieren an, um genomische Varianten in gezielten Genen/Regionen genau zu erkennen.

Vor dieser Studie war nicht bekannt, ob zirkuläre DNA-Tumorviren wie das Epstein-Barr-Virus (EBV) und das Kaposi-Sarkom-Herpesvirus (KSHV) circRNAs exprimieren. CD Genomics bietet circRNA-Sequenzierung an, um das Vorhandensein von circRNAs in EBV- und KSHV-Tumoren sowie Zelllinien zu überprüfen und diese von Viren produzierten circRNAs zu charakterisieren.

Bei Menschen ist KIAA1429 ein Homolog von D. melanogaster Virilizer (Vir), kombiniert mit METTL3, ist erforderlich für m⁶Eine Schriftstelleraktivität bei Säugetieren. CD Genomics bietet eine vielseitige Methode, das gesamte Genom-Sequenzieren, zur Erkennung von Mutationen in vir-1 Mutant von Arabidopsis thaliana.

Frühgeburt ist die Hauptursache für perinatale Morbidität und Mortalität. Der Konsum einer fettreichen Ernährung kann die Raten spontaner Frühgeburten erhöhen. Die zugrunde liegenden Mechanismen sind jedoch noch unklar. CD Genomics bietet sowohl 16S rRNA-Sequenzierung als auch RNA-Seq an, um die Verbindung zwischen fettreicher Ernährung und Frühgeburt zu untersuchen.

Die Hefestrain ISA1307, die aus einem Sektwerk isoliert wurde, wurde früher als die Zygosaccharomyces bailii Arten. Die Ganzgenom-Shotgun-Sequenzierung in dieser Arbeit zeigt jedoch, dass der Stamm ISA1307 ein interspezifischer Hybrid ist zwischen Z. bailii und eine eng verwandte Art.

Die wichtigsten Einschränkungen für kultivierte Erdnüsse (Erdnuss) sind Trockenheit und Pilzkrankheiten. Zwei wilde Verwandte der Erdnuss weisen Resistenzen gegen Trockenheit oder Pilzinfektionen auf. CD Genomics bietet globale Transkriptomanalysen an, um Gene zu identifizieren, die an Reaktionen auf biologische Prozesse wie Pilzkrankheiten und Trockenheit beteiligt sind.

Mehrere realweltliche Projekte, darunter die Regulierung von CAR-T-Zellen durch IL-4, der Vergleich von Phagengenomen, die Assemblierung von mitochondrialen Genomen und die RNA-seq-Analyse von Mäusen, zeigen praktische Anwendungen der Bioinformatik in verschiedenen Forschungsbereichen. CD Genomics bietet maßgeschneiderte Transkriptom- und Multi-Omics-Analysen an, um die Entdeckung und Interpretation von Genen in komplexen biologischen Prozessen zu unterstützen.

CAR-T-Zellansätze sind durch Zellerschöpfung begrenzt, was ihre Wirksamkeit beeinträchtigt. Wildtyp-Immunzellen zeigen eine Resistenz gegen Erschöpfung. CD Genomics bietet RNA-seq, ATAC-seq und CRISPR-Screening an, um Genexpression und Chromatinveränderungen in der Immunforschung zu untersuchen.

ChIP-seq und RNA-seq wurden verwendet, um die Genregulation in ABCG2⁺ L3.6pl Tumorsphären zu untersuchen. ChIP-seq identifizierte Co-Bindungsstellen von PHF5A und PHF14, während RNA-seq Veränderungen der Genexpression nach der Hemmung von KMT2A aufdeckte. CD Genomics bot umfassende Unterstützung zur Förderung der Forschung zu Krebsstammzellen.

Die Entwicklung von Chloroplasten ist komplex, und die Identifizierung wichtiger regulatorischer Faktoren kann herausfordernd sein. DAP-seq ermöglicht eine hochauflösende Kartierung von Bindungsstellen für Transkriptionsfaktoren und offenbart kritische regulatorische Netzwerke. CD Genomics bietet DAP-seq, RNA-seq und bioinformatische Dienstleistungen an, um die Genexpression und Chromatindynamik in der Pflanzenforschung zu untersuchen.