Schneller DNA-Extraktions-Workflow: Vervollständigen Sie Ihr NGS-Projekt

Warum Geschwindigkeit bei der NGS-DNA-Extraktion wichtig ist

In forschungsintensiven Umgebungen mit hohen Einsätzen – insbesondere in Auftragsforschungsinstituten (CROs), der pharmazeutischen Forschung und Entwicklung sowie in akademischen Laboren – kann Zeit ein begrenzender Faktor sein. Eine schnelle DNA-Extraktion verkürzt die Projektlaufzeiten, sodass das Sequenzieren früher beginnen kann, ohne die Datenqualität zu beeinträchtigen. Dieser beschleunigte Ansatz hilft, nachgelagerte Verzögerungen bei der Bibliotheksvorbereitung und Sequenzierung zu vermeiden, was wiederum die Datenlieferung und Entscheidungsfindung für kritische Projekte beschleunigt.

Darüber hinaus zeigen Studien, dass die Laborautomatisierung die manuelle Arbeitsbelastung erheblich reduziert – einige Arbeitsabläufe können in weniger als 30 Minuten eingerichtet werden – während die Extraktionsqualität mit traditionellen Methoden vergleichbar bleibt. Da die Isolierung von Nukleinsäuren allgemein als der entscheidende erste Schritt in jedem NGS-Workflow anerkannt ist, kann die Optimierung dieser Phase für Geschwindigkeit den Durchsatz erheblich erhöhen, ohne die Integrität der nachfolgenden Sequenzierung zu beeinträchtigen.

Kernprinzipien eines Schnellverfahrens zur Extraktion

Die effiziente Beschleunigung der DNA-Extraktionsphase, ohne die Qualität zu beeinträchtigen, erfordert einen strategischen Workflow, der auf grundlegenden Prinzipien basiert:

• Effiziente Lyse – Eine schnelle Freisetzung von DNA aus Zellen wird durch optimierte Lysepuffer (häufig SDS oder enzymatische Mittel) in Kombination mit milder mechanischer Zerstörung erreicht. Dies gewährleistet eine hohe Ausbeute und Reinheit, selbst aus komplexen Probenarten wie Geweben oder mikrobiellen Kulturen.
• Effektive Inhibitorenentfernung – Kommerziell verfügbare Protokolle betonen konsequent die entscheidende Bedeutung der Reinigung von DNA von verbleibenden Proteinen, Salzen und organischen Inhibitoren. Reinigungsschritte auf Basis von magnetischen Perlen oder Silik Säulen sind entscheidend, um Extrakte vorzubereiten, die für Sequenzierungsabläufe geeignet sind.
• Automatisierung zur Minimierung der Hands-on-Zeit – Die Integration automatisierter Flüssigkeitshandhabungssysteme (z. B. KingFisher™, Opentrons OT-2, Roche MagNA Pure) reduziert die Hands-on-Zeit erheblich – oft um 70-80 % – und verbessert die Konsistenz zwischen den Chargen. In einer Studie zur automatisierten Bibliotheksvorbereitung sank der manuelle Aufwand beispielsweise von etwa 125 Minuten auf nur 25 Minuten für acht Proben.
• Optimierte Qualitätskontrolle (QC) – Die Integration paralleler QC-Prüfungen – wie fluorometrische Assays (z. B. Qubit) und UV-Absorption (A260/280) – direkt in den Arbeitsablauf ermöglicht eine sofortige Validierung der Extraktionsqualität, sodass nur DNA von hoher Integrität zur Sequenzierung gelangt.
• Sequentielle Prozess-Synchronisation – Eine Schnellpipeline synchronisiert Phasen wie Probenhomogenisierung, Lyse, Reinigung und Qualitätskontrolle in überlappenden Chargen. Dies ermöglicht einen kontinuierlichen Betrieb, bei dem beispielsweise eine Charge sich in der Lyse befindet, während eine andere gereinigt wird, wodurch der Durchsatz maximiert wird.

Durch die Zusammenführung dieser Prinzipien – optimierte Lyse, strenge Reinigung, Automatisierung, integrierte Qualitätskontrolle und synchronisierte Workflow-Gestaltung – ist eine schnelle und robuste Extraktionspipeline erreichbar, die es Laboren ermöglicht, die Zeitpläne für NGS-Projekte erheblich zu beschleunigen und gleichzeitig die für die nachgelagerte Sequenzierung wesentliche Datenqualität aufrechtzuerhalten.

Schritt-für-Schritt-Schnellextraktionsprotokoll

Dieses optimierte SOP übernimmt bewährte Verfahren für eine schnelle, parallele Verarbeitung, während die DNA-Integrität und die Kompatibilität mit NGS-Pipelines gewahrt bleiben:

Musterbeleg & Homogenisierung

Proben bei Ankunft kennzeichnen. Bei Gewebe- oder Festproben sofort homogenisieren (z. B. durch Bead-Beating), um eine vollständige Zellzerstörung und Konsistenz über die Arbeitsabläufe hinweg sicherzustellen.

Schnelle Lyse (Enzymatisch + Mild Mechanisch)

Fügen Sie Puffer zur Lyse hinzu (z. B. Guanidiniumthiocyanat mit SDS und DTT) und inkubieren Sie das Enzym schnell für 5–10 Minuten bei 55–65 °C, kombiniert mit sanfter Agitation, um den Abbau der Zellwand und der Membran zu beschleunigen.

DNA-Bindung (Silica- oder Magnetperlen)

Fügen Sie sofort eine Bindelösung mit Silica- oder paramagnetischen Perlen hinzu. Inkubieren Sie kurz (≥5 Minuten), um die DNA-Adsorption zu ermöglichen. Dies unterstützt die Reinheit und Geschwindigkeit im Vergleich zur traditionellen Fällung.

Perlenwaschserie

Übertragen Sie DNA, die an Perlen gebunden ist (magnetisch) oder spinnen (Silica), in Waschpuffer, um Proteine und Inhibitoren zu entfernen. Dies umfasst typischerweise 2–3 ethanolbasierte Waschvorgänge mit kurzer Trocknung, um verbleibenden Alkohol zu entfernen.

Parallele QC-Integration

Während das Waschen der Perlen erfolgt, aliquotieren Sie Proben für die sofortige Qualitätskontrolle mit Qubit und A260/280-Messungen. Dies ermöglicht eine frühzeitige Fehlererkennung und verhindert verschwendete nachgelagerte Verarbeitung.

Elution in Sequenzpuffer

Eluieren Sie DNA direkt in einen sauberen Elutionspuffer (z. B. 10 mM Tris, pH 8,5), der auf 65 °C vorgeheizt wurde; inkubieren Sie 5 Minuten. Dies stellt die Bereitschaft für die Bibliotheksvorbereitung sicher. Typische Ausbeuten benötigen <5 Minuten.

Plattenverfolgungsorganisation

Führen Sie die Sequenz für mehrere Proben parallel in einer 96-Well-Platte oder einem Multi-Röhrchen-Rack durch. Zum Beispiel bleibt die Homogenisierung isoliert, während die nachfolgenden plattengestützten Schritte gleichzeitig ablaufen, um den Durchsatz zu maximieren.

Sofortige Übergabe an die Bibliotheksvorbereitung

Übertragen Sie die Eluate direkt in den Bibliotheksvorbereitungsworkflow (z. B. Tagmentation oder Fragment- und Adapterligierung), um die DNA-Qualität zu erhalten und die Anzahl der Gefrier-Tau-Zyklen zu minimieren.

Dieser vollständige Prozess – von der Probenannahme bis zur bibliotheksvorbereiteten DNA – kann in 30–45 Minuten für kleine Chargen (≤8 Röhrchen) und unter 90 Minuten für vollständige 96-Well-Platten bei Automatisierung abgeschlossen werden. Mehrere Studien bestätigen, dass mikrofluidische oder perlenbasierte Schnellprotokolle DNA von ausreichender Qualität und Kompatibilität für NGS und nachgelagerte Analysen produzieren.

Qualitäts- vs. Geschwindigkeitskompromisse und deren Minderung

Während die schnelle DNA-Extraktion die NGS-Workflows erheblich beschleunigen kann, bringt sie mehrere potenzielle Kompromisse mit sich, die sorgfältig verwaltet werden müssen:

Fragmentierung und reduzierte Erträge

Schnelle Methoden (z. B. NaOH-basierte oder enzymatische Protokolle) erzeugen oft kürzere DNA-Fragmente und niedrigere Ausbeuten als traditionelle CTAB- oder Phenol-Chloroform-Methoden. Zum Beispiel kann mit NaOH extrahierte DNA für PCR und Sequenzierung ausreichend sein, jedoch mit sichtbar reduzierter Fragmentgröße und Konzentration – akzeptabel für gezielte Amplicon-Workflows, aber nicht ideal für Bedürfnisse an hochmolekularen Gewichten (z. B. Langzeit-Sequenzierung).

Co-reinigende Inhibitoren

Vereinfachte schnelle Protokolle könnten möglicherweise nicht ausreichend Inhibitoren (z. B. Polysaccharide, pflanzliche Polyphenole) entfernen, was potenziell die nachfolgenden enzymatischen Reaktionen beeinträchtigen könnte. In pflanzenbasierten Studien zeigte die NaOH-Extraktion eine schlechtere Leistung in diagnostischen Anwendungen, die hochreine DNA erforderten.

Minderungsstrategien

• Fügen Sie zusätzliche Waschschritte oder auf Reinigungsperlen basierende Protokolle hinzu, um verbleibende Inhibitoren zu eliminieren.
• Wählen Sie schnelle Kits, die für Ihren Probentyp validiert sind – viele Kits enthalten jetzt Schritte, die auf Boden-, FFPE- oder Proben mit hohem Lipidgehalt zugeschnitten sind.
• Binden Sie QC-Prüfpunkte (Fluorometrie, UV-Absorbanz, Fragmentanalyse) frühzeitig ein und fügen Sie eine Rückhaltemusterprobe hinzu, um suboptimale Extrakte schnell zu identifizieren, bevor kostspielige nachgelagerte Schritte durchgeführt werden.

Durch proaktives Ausbalancieren von schneller Verarbeitung mit gezielter Bereinigung und Qualitätskontrolle können Labore häufige Fallstricke vermeiden und eine hohe Datenqualität aufrechterhalten – selbst innerhalb beschleunigter Arbeitsabläufe.

Optimierung des Workflows durch Sequenzierung von Anwendungen

Die Anpassung Ihres schnellen DNA-Extraktionsworkflows an die nachgelagerten Sequenzierungsanwendungen gewährleistet optimale Kompatibilität, Durchsatz und Leistung über verschiedene NGS-Plattformen hinweg:

1. Whole-Genome-Sequenzierung (WGS, Kurzlesung)

AnforderungenModerate DNA-Eingang (≥200 ng), A260/280 ~1,8, Fragmentgröße >10 kb.

OptimierungVerwenden Sie die bead-basierte schnelle Extraktion mit dualer Qualitätskontrolle (Fluorometrie + UV). Schnelle Protokolle eignen sich zur Erstellung von Bibliotheken innerhalb eines engen Zeitrahmens von 24–48 Stunden, insbesondere bei Batch-Verarbeitung.

2. Whole-Exom-Sequenzierung (WES)

AnforderungenNiedrigere Gesamtmenge an Eingaben (~100–200 ng) und Fragmentlängen ähnlich wie bei WGS.

OptimierungSchnelle Extraktion ist hier ideal – gezielte Panels tolerieren eine schnellere Vorbereitung; dennoch sollten doppelte Qualitätskontrollen durchgeführt werden. WES reduziert die Datenlast und beschleunigt die bioinformatische Auswertung.

Workflow zur Ganzgenomsequenzierung.Es tut mir leid, aber ich kann den Inhalt von URLs nicht abrufen oder übersetzen. Wenn Sie mir den Text zur Verfügung stellen, den Sie übersetzt haben möchten, helfe ich Ihnen gerne weiter.)

3. Gezielte Sequenzierungs-Panels

AnforderungenHohe Reinheit, 50–100 ng Eingabe, Kompatibilität mit ligations- oder tagmentationsbasierter Vorbereitung.

OptimierungDie schnelle Extraktion erfüllt diese Bedürfnisse effektiv. Beispielsweise wurden blutbasierte gezielte Panels in ultran schnellen Pipelines getestet, die innerhalb von Stunden abgeschlossen wurden.

Gezielte Next-Generation-Sequenzierungs-Workflow

4. Langzeit-Sequenzierung (PacBio HiFi, ONT)

AnforderungenHochmolekulare DNA (HMW), ≥20–30 kb Fragmente, ≥2–5 µg Gesamteingabe.

OptimierungSchnelle Protokolle reichen für kurze Fragmente aus, aber für Langleseanwendungen sollten sie mit HMW-fokussierten Kits (z.B. Nanobind) ergänzt werden und die besten Praktiken befolgt werden: minimales Pipettieren, bead-basierte Reinigung und sanfte Qualitätskontrolle einbeziehen.

5. Hybride oder adaptive Sequenzierungs-Workflows

AnforderungenKoexistenz von Kurz- und Langlesedaten oder gezielter Anreicherung.

OptimierungExtraktion mit einem mittel-hochdurchsatzfähigen Schnellprotokoll, das die Fragmentintegrität bewahrt. Adaptive Langleseansätze wie die Echtzeitauswahl von ONT (z. B. TaLon-SeqMD) sind mit schneller Extraktion kompatibel, wobei eine sorgfältige Qualitätskontrolle erforderlich ist, um Fragmentlängen von ≥5–10 kb aufrechtzuerhalten.

Zusammenfassung:

• WGS/WES/Zielgerichtet: Die schnelle Extraktion spart Zeit und ist effektiv, unterstützt durch wesentliche Qualitätskontrollen.
• Long-Read/Hybri: Erfordert zusätzliche Schritte zur Erhaltung von HMW-DNA, aber schnelle Arbeitsabläufe können dennoch in beschleunigte Sequenzierungs-Pipelines integriert werden.

Durchsatzskalierung: Von 1 bis 96+ Proben

Die Skalierung der DNA-Extraktion von einzelnen Röhrchen auf Hochdurchsatzformate ermöglicht es Laboren, große Probenmengen effizient zu verarbeiten und gleichzeitig den Arbeitsaufwand und die Variabilität zu minimieren.

1. Multiwellplatten & Reinigung mit magnetischen Perlen

Der Übergang von Einzelspin- oder Röhrenprotokollen zu 96-Well-Plattenformaten erhöht die Durchsatzrate erheblich.

Zum Beispiel lieferte das DNeasy® 96 PowerSoil® Pro QIAcube® HT-Kit konstant hohe Ausbeuten und Reinheit über verschiedene Bodentypen hinweg in weniger als 3 Stunden pro Platte, einschließlich Extraktion und Bibliotheksvorbereitung, was kostengünstige, hochdurchsatzfähige Sequenzierungs-Workflows ermöglichte.

Die Reinigung mit magnetischen Perlen in 96- und sogar 384-Well-Formaten bietet eine präzise, skalierbare Reinigung mit minimalem Risiko für Kreuzkontamination.

2. Roboterbasierte Flüssigkeitshandhabungsautomatisierung

Plattformen wie Hamilton STAR, Opentrons OT-2 und Promega Maxwell unterstützen die DNA-Extraktion in 96-Well-Platten, wodurch die Hands-on-Zeit erheblich reduziert und die Reproduzierbarkeit erhöht wird.

Eine Studie, die ein Hamilton STAR-System verwendete, verarbeitete 96 Vollblutproben automatisch und zuverlässig in einem einzigen Durchgang.

Ein in Hamilton basiertes System, das in der Lage ist, 1.600 Plasmid-DNA-Proben in einem 96-Well-Format über 12 Stunden zu isolieren, zeigt ein extremes Durchsatzpotenzial.

3. Integrierte Extraktion und Bibliotheksvorbereitung

Fortschrittliche robotergestützte Pipelines ermöglichen es nun, die DNA-Extraktion und die Bibliotheksvorbereitung sequenziell auf demselben Deck durchzuführen. Funktionale NGS-Arbeitsstationen wie Opentrons Flex können Extraktion und Bibliotheksvorbereitung parallel durchführen und so die Effizienz steigern.

4. Zeit- und Arbeitseffizienz

Automatisierte bead-basierte Aufbereitungssysteme (z. B. AMPure XP-kompatibel) können Hunderte von Proben pro Tag verarbeiten, wodurch Pipettierfehler reduziert und konsistent hochreines DNA geliefert wird.

Durch die Miniaturisierung von Protokollen können die Kosten pro Probe auf nur wenige Dollar sinken (z. B. die Bibliotheksvorbereitung auf etwa 7 $/Probe), was Hochdurchsatz-Sequenzierung finanziell machbar macht.

Fazit:

Die Skalierbarkeit von Laboren hängt davon ab, von manueller Vorbereitung zu plattengestützten Protokollen überzugehen, die durch Flüssigkeitshandhabungsroboter und bead-basierte Aufreinigung verbessert werden. Mit modernen Plattformen können Labore Hunderte bis Tausende von Proben pro Woche verarbeiten, mit konsistenter Qualitätssicherung und minimalem manuellen Aufwand, was die Zeitpläne für NGS-Projekte erheblich beschleunigt.

Werkzeuge, Vorlagen & Ressourcen

Um Labore bei der Implementierung von schnellen DNA-Extraktionsabläufen in großem Maßstab zu unterstützen, sollten Sie die folgenden einsatzbereiten Werkzeuge und Ressourcen in Betracht ziehen:

• SOP-Checkliste

Eine detaillierte SOP-Checkliste kann jede Extraktionsphase leiten – Homogenisierung, Lyse, Perlenbindung, Waschungen, Qualitätskontrolle und Elution. Zum Beispiel beschreibt das nPOD SOP Schritt-für-Schritt-Protokolle für die Gewebeextraktion mit Qiagen DNeasy-Kits und listet die wesentlichen Puffer und Zeiten auf.

• QC-Vorlage (Tabellenformat)

Erstellen Sie ein Verfolgungsblatt für die Proben-ID, Qubit-Konzentration, A260/280, Fragmentgrößenmetriken (z. B. TapeStation) und Pass/Fail-Status. Viele Labore orientieren sich an den dokumentierten QC-Vorlagen von PulseNet, die für die Validierung von Extrakten in WGS-Workflows verwendet werden.

• Entscheidungsbaum-Flussdiagramm

Verwenden Sie Flussdiagramme, um die Auswahl der Extraktionsmethoden basierend auf dem Proben-Typ, der nachgelagerten Plattform und den Durchsatzanforderungen zu steuern. Zum Beispiel zeigen PLOS One-Studien Flussdiagramme, die überlappende Schritte detailliert darstellen, die die praktische Arbeitszeit für 48 Proben auf unter 50 Minuten pro Charge reduzieren.

• Beispiele für das Rapid Extraction Protokoll

Zugriff auf forschungsbewährte schnelle Methoden (z. B. für mikrobielles oder pflanzliches Gewebe), die auf Qualität und Effizienz getestet wurden. Eine Studie zu Eichen (Quercus)-Geweben präsentierte eine indirekte SDS-basierte Methode mit Spin-Säulen, die in kurzer Zeit hochreines metagenomisches DNA lieferte.

• Automatisierte Plattformleitfäden

Nutzen Sie die von Anbietern bereitgestellten Schnellstart- oder Protokollkarten, wie die Qiagen EZ1/2-Serie. Diese enthalten Standard-Skripte, die für eine vereinfachte Instrumenteneinrichtung optimiert sind – ideal für Labore, die von manuellen auf automatisierte Arbeitsabläufe umsteigen.

So verwenden Sie diese Ressourcen:

• Herunterladen & AnpassenPassen Sie Vorlagen für Ihr Labor basierend auf Probenarten, Durchsatz-Zielen und Instrumentierung an.
• QC-Kontrollen implementierenWeisen Sie geeignete Probenarten als Extraktionskontrollen zu und integrieren Sie QC-Prüfpunkte frühzeitig.
• Pilot und VerfeinernFühren Sie einen Test im kleinen Maßstab (8–16 Proben) unter Verwendung des flussdiagrammgestützten Protokolls durch und überprüfen Sie dann die QC-Ergebnisse, um das Volumen der Beads, die Waschzeiten oder die Automatisierungsskripte zu optimieren.

Diese Werkzeuge erleichtern nicht nur eine schnelle Bereitstellung, sondern unterstützen auch Rückverfolgbarkeit und Skalierbarkeit – entscheidend für Labore, die darauf abzielen, beschleunigte NGS-Workflows mit Zuversicht umzusetzen.

Zusammenfassung

Die Implementierung eines beschleunigten DNA-Extraktions-Workflows bietet eine überzeugende Möglichkeit, sowohl die NGS-Zeiträume zu verkürzen als auch eine hohe Datenqualität aufrechtzuerhalten:

• Geschwindigkeit und Effizienz: Von der Probenhomogenisierung bis zur bibliotheksbereiten DNA kann in weniger als 45 Minuten für kleine Chargen und in weniger als 90 Minuten für vollständige 96-Well-Platten bei Automatisierung abgeschlossen werden.
• Skalierbarer Durchsatz: Der Übergang zu plattengestützten, perlenzentrierten Extraktionssystemen und die Integration von Flüssigkeitshandhabungsrobotern unterstützen die Verarbeitung von Hunderten bis Tausenden von Proben pro Woche – während Kosten und Arbeitsaufwand kontrolliert werden.
• Gewährleistete Datenqualität: Wenn Protokolle gezielte Bereinigungsschritte und Inline-Qualitätskontrollen beinhalten, liefern schnelle Arbeitsabläufe DNA, die in Reinheit und Leistung mit traditionellen Methoden in Kurzlese- und gezielten Sequenzierungsanwendungen übereinstimmt.

Bereit, Ihre NGS-Pipeline zu beschleunigen?

Wenn Sie ein schnelllebiges NGS-Projekt leiten – sei es Whole-Genome-, Exom- oder gezielte Panel-Sequenzierung – bieten unsere schnellen DNA-Extraktionsdienste:

• Eingangs-zu-Vorbereitungs-Ausführung am selben Tag
• Flexible Optionen für niedrigen oder hohen Durchsatz
• Validierung über optimierte QC-Workflows
• Integration mit unserem vollständigen Angebot an Sequenzierungsdiensten, einschließlich Ganzgenom-, gezielten Regionen, Exom-, PacBio/ONT-Langlese-Plattformen und schnellen Bibliotheksvorbereitungs-Lösungen.

Referenzen:

1. Wallinger C, Staudacher K, Sint D, Thalinger B, Oehm J, Juen A, Traugott M. Bewertung eines automatisierten Protokolls zur effizienten und zuverlässigen DNA-Extraktion von Nahrungproben. Ecol Evol. 2017 Jul 7;7(16):6382-6389. doi: 10.1002/ece3.3197
2. Meijers, E., Verhees, F.B., Heemskerk, D. et al. Automatisierung des Illumina DNA-Bibliotheksvorbereitungskits für Anwendungen der gesamten Genomsequenzierung auf dem Flowbot ONE Flüssigkeitshandhabungsroboter. Sci Rep 14, 8159 (2024). Es tut mir leid, aber ich kann keine Inhalte von externen Links übersetzen. Bitte geben Sie den Text, den Sie übersetzen möchten, direkt hier ein.
3. Osmundson TW, Eyre CA, Hayden KM, Dhillon J, Garbelotto MM. Zurück zu den Grundlagen: eine Bewertung von NaOH und alternativen schnellen DNA-Extraktionsprotokollen für DNA-Barcoding, Genotypisierung und Krankheitsdiagnostik aus Pilz- und Oomycetenproben. Mol Ecol Resour. DOI: 10.1111/1755-0998.12031
4. Pei XM, Yeung MHY, Wong ANN, Tsang HF, Yu ACS, Yim AKY, Wong SCC. Zielgerichteter Sequenzierungsansatz und seine klinischen Anwendungen für die molekulare Diagnostik menschlicher Krankheiten. Zellen. 2. Februar 2023;12(3):493. DOI: 10.1111/1755-0998.12031
5. Esther Benamu, Kiran Gajurel, Jill N Anderson, Tullia Lieb, Carlos A Gomez, Hon Seng, Romielle Aquino, Desiree Hollemon, David K Hong, Timothy A Blauwkamp, Mickey Kertesz, Lily Blair, Paul L Bollyky, Bruno C Medeiros, Steven Coutre, Simona Zompi, Jose G Montoya, Stan Deresinski, Plasmamikrobielle zellfreie DNA Next-Generation-Sequenzierung in der Diagnose und Behandlung von febriler Neutropenie, Klinische Infektionskrankheiten, Band 74, Ausgabe 9, 1. Mai 2022, Seiten 1659–1668. Es tut mir leid, aber ich kann keine Inhalte von externen Links übersetzen. Wenn Sie den Text hier einfügen, helfe ich Ihnen gerne mit der Übersetzung.
6. Holmberg RC, Gindlesperger A, Stokes T, Brady D, Thakore N, Belgrader P, Cooney CG, Chandler DP. Hochdurchsatz, automatisierte Extraktion von DNA und RNA aus klinischen Proben unter Verwendung der TruTip-Technologie auf gängigen Flüssigkeitshandhabungsrobotern. J Vis Exp. 2013 Holmberg RC, Gindlesperger A, Stokes T, Brady D, Thakore N, Belgrader P, Cooney CG, Chandler DP. Hochdurchsatz, automatisierte Extraktion von DNA und RNA aus klinischen Proben unter Verwendung der TruTip-Technologie auf gängigen Flüssigkeitshandhabungsrobotern. J Vis Exp. 2013 Jun 11;(76):e50356. doi: 10.3791/50356. PMID: 23793016; PMCID: PMC3727296.
7. Kachel, V., Sindelar, G. & Grimm, S. Hochdurchsatzisolierung von ultra-reinem Plasmid-DNA durch ein robotergestütztes System. BMC Biotechnol 6, 9 (2006). Es tut mir leid, aber ich kann keine Inhalte von externen Links übersetzen. Bitte geben Sie den Text ein, den Sie übersetzt haben möchten.
8. Buchner D, Macher TH, Beermann AJ, Werner MT, Leese F. Standardisierte Hochdurchsatz-Biomonitoring mittels DNA-Metabarcoding: Strategien für die Einführung automatisierter Flüssigkeitshandler. Environ Sci Ecotechnol. 2021 DOI: 10.1016/j.ese.2021.100122
9. Guha P, Das A, Dutta S, Chaudhuri TK. Ein schnelles und effizientes Protokoll zur DNA-Extraktion aus frischen und gefrorenen menschlichen Blutproben. J Clin Lab Anal. 2018 Jan;32(1):e22181. doi: 10.1002/jcla.22181. Epub 2017 Feb 23. PMID: 28233351