LncRNA-Mikroarray-Service

CD Genomics bietet einen umfassenden LncRNA (Long non-coding RNA) Mikroarray-Profilierungsdienst an, der einige der fortschrittlichsten Plattformen in diesem Bereich nutzt. Unsere Methoden gewährleisten unvergleichliche Genauigkeit und Sensitivität. Durch strenge, schrittweise Qualitätskontrollverfahren verpflichten wir uns, hochzuverlässige und reproduzierbare Ergebnisse zu liefern.

Einführung in LncRNA-Mikroarray

LncRNAs sind eine vielfältige und umfangreiche Klasse von transkribierten RNA-Molekülen, die jeweils über 200 Nukleotide lang sind und keine Proteine kodieren. Ihre Expression wird während der Entwicklung komplex reguliert und kann stark spezifisch für bestimmte Gewebe oder Zelltypen sein. Ein bemerkenswerter Anteil der lncRNAs befindet sich ausschließlich im Zellkern.

Diese Moleküle werden als bedeutende Regulatoren angesehen, die neue Ebenen der Komplexität in unser Verständnis der genomischen Regulation einbringen. Die Spezifität und regulatorischen Funktionen von lncRNAs unterstreichen ihre Bedeutung im komplexen Netzwerk der Genexpression.

Die LncRNA-Mikroarray-Technologie hebt sich als ein anspruchsvolles Werkzeug zur Analyse der lncRNA-Expression in verschiedenen biologischen Szenarien hervor. Im Gegensatz zu RNA-Sequenzierung, die bei lncRNAs mit geringer Häufigkeit schwanken können, zeichnen sich Mikroarrays durch hochdurchsatzfähige Profilierung aus. Diese Arrays sind so konzipiert, dass sie Tausende von lncRNAs zusammen mit protein-codierenden mRNAs in einem einzigen Experiment nachweisen können. Durch die Nutzung fortschrittlicher Sondenentwürfe und umfangreicher lncRNA-Datenbanken ermöglichen Mikroarrays eine eingehende Bewertung der Dynamik der lncRNA-Expression.

CD Genomics bietet einen erstklassigen lncRNA-Mikroarray-Service, der modernste Technologie mit strengen Qualitätskontrollen verbindet. Der Service umfasst jeden Schritt von der Probenvorbereitung und Array-Hybridisierung bis hin zur gründlichen Datenanalyse, um sicherzustellen, dass die Ergebnisse sowohl von hoher Qualität als auch zuverlässig sind.

Vorteile und Eigenschaften von LncRNA-Mikroarray

• Außergewöhnliche Sensibilität und Präzision Mikroarrays niedrig-abundante lncRNAs mit hoher Genauigkeit erkennen und RNA-seq in der Quantifizierung dieser subtilen Ausdrücke übertreffen.
• Umfangreiche DatenabdeckungCD Genomics verwendet umfassende und aktuelle Datenbanken wie GENCODE und RefSeq, um eine breite und aktuelle Abdeckung von lncRNA zu gewährleisten.
• Gründliche Annotation und AnalyseDer Service umfasst eine detaillierte Annotation und Analyse, die den genomischen Kontext und die subzelluläre Lokalisation abdeckt, um die Funktionen von lncRNA zu erläutern.
• Maßgeschneiderte LösungenCD Genomics bietet anpassbare Mikroarray-Lösungen, die auf spezifische Forschungsbedürfnisse zugeschnitten sind, und bietet flexible sowie personalisierte Optionen.
• Erhalten Sie hochwertige Daten schnell und ohne Aufwand.
• Ein einzigartiger Abschlussbericht mit kostenloser grundlegender Datenanalyse.
• Daten und Berichte werden auf sichere Weise bereitgestellt.

Anwendungen von LncRNA-Mikroarrays

• Globale Profilierung langer Transkripte
• Krebsforschung
• Herz-Kreislauf-Erkrankungen
• Neurologische Erkrankungen

LncRNA-Mikroarray-Dienstleistungsablauf

Dienstspezifikationen

	Musteranforderungen Arten: Mensch, Maus, Ratte RNA-Proben und gut erhaltene Gewebe- oder Zellproben RNA≥200 ng Hinweis: Musterbeträge sind nur zur Referenz aufgeführt. Für detaillierte Informationen, bitte kontaktieren Sie uns mit Ihren maßgeschneiderten Anfragen.
Klicken	Sequenzierungsstrategie Sie können sich auf die folgenden Empfehlungen und den Kundenservice beziehen.
	Bioinformatikanalyse Wir bieten mehrere maßgeschneiderte bioinformatische Analysen an, einschließlich, aber nicht beschränkt auf: GO-Analyse Weganalyse Differenzielle lncrna-Expressionsanalyse Differenzielle Genexpressionsanalyse Hinweis: Die empfohlenen Datenausgaben und Analyseinhalte, die angezeigt werden, dienen nur zur Referenz. Für detaillierte Informationen, bitte Kontaktieren Sie uns mit Ihren maßgeschneiderten Anfragen.

Empfehlungen und Kundenservice

Tabelle1 Agilent LncRNA-Expressions-Mikroarrays

Analyse-Pipeline

Liefergegenstände

• Die Rohdaten
• Experimentelle Ergebnisse
• Datenanalysebericht
• Details in LncRNA-Mikroarray für Ihre Schrift (Anpassung)

CD Genomics kann auch helfen, Ihr benutzerdefiniertes LncRNA-Mikroarray zu erstellen. Wir sind bereit, Ihnen bei Ihren individuellen Array-Bedürfnissen zu helfen, egal ob es sich um ein Standarddesign oder etwas Kreativeres handelt.

Also, was Sie tun müssen, ist uns Ihre Proben zu senden, wir können Ihnen den qualifizierten Abschlussbericht anbieten. Für weitere Informationen können Sie uns jederzeit gerne kontaktieren, indem Sie ein unverbindliches Formular ausfüllen. Anfrage für ein Angebot.

Teilweise Ergebnisse sind unten aufgeführt:

1. Welche Herausforderungen sind mit der Erkennung von lncRNAs im Vergleich zu mRNAs verbunden?

Die Erkennung von langen nicht-kodierenden RNAs (lncRNAs) stellt im Vergleich zu messenger RNAs (mRNAs) besondere Herausforderungen dar, hauptsächlich aufgrund ihrer von Natur aus niedrigeren Expressionsniveaus und ausgeprägten Gewebespezifität. Die einzigartigen Eigenschaften von lncRNAs, wie ihre geringe Häufigkeit und umfangreiche Isoformvielfalt, führen zu zusätzlicher Komplexität in ihrer Analyse. Um diese Hindernisse effektiv zu überwinden, unser Mikroarray wurden sorgfältig entwickelt, um die präzise Erkennung und Quantifizierung von lncRNAs sicherzustellen, trotz ihrer komplexen Natur.

2. Wie vergleicht sich die Empfindlichkeit von lncRNA-Mikroarrays mit der von RNA-Sequenzierung?

In Bezug auf die Sensitivität zeigen lncRNA-Mikroarrays eine überlegene Leistung bei der Erkennung von lncRNAs mit geringer Häufigkeit im Vergleich zur RNA-Sequenzierung. Die RNA-Sequenzierung kann auf Genauigkeitsprobleme stoßen, die insbesondere aus hohen Fehlerquoten und den von Natur aus niedrigen Expressionsniveaus dieser Transkripte resultieren. Im Gegensatz dazu bieten unsere Mikroarrays zuverlässige Messungen mit minimaler Anfälligkeit für Variationen, die durch eine niedrige Transkript-Häufigkeit verursacht werden, und verbessern damit die gesamte Sensitivität der Detektion.

3. Können lncRNA-Mikroarray-Analysen verschiedene Transkript-Isoformen nachweisen?

Absolut, unsere lncRNA-Mikroarray sind in der Lage, verschiedene Isoformen zu differenzieren und zu detektieren. Im Gegensatz zu mRNAs sind lncRNAs dafür bekannt, mehrere Isoformen zu erzeugen, von denen jede einzigartige biologische Rollen spielt. Unser fortschrittliches Mikroarray-Design gewährleistet die genaue Identifizierung und Quantifizierung dieser vielfältigen Isoformen und bietet somit ein umfassendes Verständnis der Funktionalität von lncRNAs.

4. Wie vergleicht sich die Genauigkeit der lncRNA-Quantifizierung in Mikroarrays mit Sequenzierungsmethoden?

Bei der Quantifizierung von lncRNAs mit niedriger Abundanz bietet die Mikroarray-Technologie eine höhere Genauigkeit im Vergleich zu Sequenzierungsmethoden, die oft durch höhere Fehlerquoten und Abdeckungsbeschränkungen beeinträchtigt werden. Unsere Mikroarrays sind sorgfältig entwickelt, um diese Probleme zu mindern, was zu zuverlässigeren und umfangreicheren Daten führt, die die Präzision der lncRNA-Quantifizierung erheblich verbessern.

5. Welche maßgeschneiderten Lösungen stehen für die Analyse von lncRNA-Mikroarrays zur Verfügung?

Wir bieten maßgeschneiderte lncRNA-Mikroarray-Lösungen, die auf spezifische Forschungsbedürfnisse zugeschnitten sind. Egal, ob Ihre Anforderungen Standard-Arrays oder innovative Designs umfassen, unsere anpassbaren Optionen stellen sicher, dass unsere Dienstleistungen genau auf Ihre Forschungsziele abgestimmt sind. Diese Flexibilität erleichtert den Erwerb gezielter und umfassender genomischer Erkenntnisse und fördert somit Ihre wissenschaftlichen Bestrebungen.

Integrierte Analyse der lncRNA- und mRNA-Expressionsprofile zeigt altersbedingte Veränderungen im Meniskus an.

Zeitschrift: Frontiers in Zell- und Entwicklungsbiologie
Impact-Faktor: 5,206
Veröffentlicht: 10. März 2022

Hintergrund

Der Meniskus, der für die Funktion des Knies entscheidend ist, verschlechtert sich mit dem Alter, was das Risiko für Osteoarthritis erhöht, bedingt durch Veränderungen wie die Verdickung von Kollagen. Lange nicht-kodierende RNAs (lncRNAs) spielen eine wichtige Rolle im Gewebealterungsprozess und könnten zur Degeneration des Meniskus beitragen. Um dies zu untersuchen, analysierte die Studie die Ausdrucksprofile von lncRNA und mRNA in jungen und alternden Menisken. Mikroarray Analyse, gefolgt von Bioinformatik, um Schlüsselmoleküle und -wege zu identifizieren, die an altersbedingten Veränderungen des Meniskus beteiligt sind.

Materialien & Methoden

Ergebnisse

Die Studie verwendete das Arraystar Human lncRNA und mRNA Array, um Meniskusgewebe aus jungen und älteren Gruppen zu vergleichen (n = 4/Gruppe). Es wurden 1608 unterschiedlich exprimierte lncRNAs und 1809 unterschiedlich exprimierte mRNAs identifiziert. Die Expressionsmuster wurden mit Vulkanplots und hierarchischer Clusteranalyse visualisiert.

ABBILDUNG 1. Identifizierung von DE lncRNAs und mRNAs.

GO- und Pathway-Analysen von 1809 differentially exprimierten mRNAs hoben wichtige Wege hervor, die an Knorpelschäden beteiligt sind, einschließlich TGF-beta, Wnt und PI3K-Akt. Die Studie identifizierte 18 mRNAs, die signifikant verändert waren, mit einer bemerkenswerten Herunterregulierung von FGF6 und PPP2R5C.

ABBILDUNG 2. Funktionelle Anreicherungsanalyse von DE mRNAs.

Eine ceRNA-Netzwerkanalyse unter Verwendung von 19 DE-mRNAs und 46 DE-lncRNAs identifizierte 98 Knoten und 229 Kanten. Das mit Cytoscape konstruierte Netzwerk hob lncRNA POC1B-AS1 hervor, die weiter auf ihre miRNA-Interaktionen und Zielgene in einem detaillierten Subnetzwerk untersucht wurde.

ABBILDUNG 3. CeRNA-Analyse.

Fazit

Diese Studie fand signifikante Veränderungen in der lncRNA- und mRNA-Expression im alternden Meniskus, einschließlich verringerter MMP-2- und COL1A2-Spiegel. Wichtige Signalwege wie Hippo und TGF-beta sind an der Meniskusdegeneration beteiligt. Abnormale lncRNA-Expressionen deuten auf neue therapeutische Ziele zur Behandlung der Meniskusdegeneration hin.

Referenz

1. Ai LY, Du MZ, Chen YR, et al. Integrierte Analyse der lncRNA- und mRNA-Expressionsprofile zeigt altersbedingte Veränderungen im Meniskus. Grenzen in der Zell- und Entwicklungsbiologie. 2022, 10:844555.