SUGAR-seq ermöglicht die gleichzeitige Erkennung von Glykane, Epitopen und dem Transkriptom in Einzelzellen.

19. Februar 2021

Zusammenfassung

Multimodale Einzelzell-RNA-Sequenzierung ermöglicht die präzise Kartierung von transkriptionalen und phänotypischen Merkmalen von zellulären Differenzierungszuständen, erlaubt jedoch keine gleichzeitige Integration kritischer posttranslationaler Modifikationsdaten. Hier beschreiben wir SUrface-protein Glycan und RNA-seq (SUGAR-seq), eine Methode, die die Erkennung und Analyse von N-verknüpfter Glykosylierung, extrazellulären Epitopen und dem Transkriptom auf Einzelzellebene ermöglicht. Integrierte SUGAR-seq- und Glykoproteomanalysen identifizierten tumorinfiltrierende T-Zellen mit einzigartigen Oberflächen-Glykan-Eigenschaften, die ihren epigenetischen und funktionalen Zustand anzeigen.

Mehr Informationen unter: https://advances.sciencemag.org/content/7/8/eabe3610